内科是校医院的主要业务科室，下设：内科门诊、急诊、呼吸内科门诊、住院部等。

口腔科集口腔内科治疗、口腔齿槽外科、口腔修复口腔正畸、口腔美白、儿童口腔预防保健为一体的现代化口腔专业诊疗科室。

体检科是校医院的重要业务部门，是全省高校范围内成立较早的非盈利性的体检部门。

校医院外科是融合了中医与西医治疗理念和手段的综合性科室。

中医康复科是校医院的重要业务科室，以祖国传统中医、针灸经络理论与现代光电物理诊疗技术相结合的科室。

公卫科承担着学校和校医院的公共卫生安全工作，以预防和控制疾病、保护师生健康、促进校园和谐为目标。

妇科是校医院的重要业务科室，主要检查和诊治各种妇科疾病。

校医院中医皮肤科是一个中西医结合的优势科室，承担学校教职工和学生的皮肤病日常诊疗、心理、预防、保健的综合服务。

医保科是校医院的重要职能部门，主要负责校医院教职工和大学生的医疗保险相关工作。

儿科是校医院2024年5月新成立的业务科室，目前开设有儿科门诊、儿科雾化等。

眼耳鼻喉科是校医院的重要业务科室，主要从事眼耳鼻喉各类疾病的诊断、治疗、预防及科普宣传，包括眼科、耳鼻喉科和医学视光中心。

检验科是校医院的一个重要业务科室，拥有临检实验室、临床生化实验室和临床免疫实验室。

影像科利用先进的影像仪器设备对患者进行相关检查和诊断，包括数字化X射线摄影、CT、超声检查等。